See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2024-05-08 13:06:42 -0400 (Wed, 08 May 2024).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 15

1ALL (3369)
2TCGAbiolinksGUI.data (3167)
3celldex (3090)
4HSMMSingleCell (2740)
5airway (1975)
6scRNAseq (1637)
7geneLenDataBase (1529)
8pasilla (903)
9tximportData (818)
10sesameData (811)
11TENxPBMCData (658)
12depmap (645)
13GSVAdata (635)
14ChAMPdata (620)
15bladderbatch (587)

All experiment packages

All experiment package stats in one file: experiment_pkg_stats.tab

All experiment package download scores in one file: experiment_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor experiment repository (all packages combined)

4

4.10.1 (1)

A

a4Core (0)
a4Reporting (0)
ABAData (8)
abc (1)
abind (1)
ace.fma (1)
acepack (2)
actuar (1)
ada (1)
adabag (1)
AdaptGauss (1)
adductData (80)
ade4 (4)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
aditools (1)
adjustedCurves (1)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (29)
ADMM (1)
AER (1)
afex (1)
affxparser (0)
affy (1)
affycompData (62)
affycoretools (0)
affydata (405)
Affyhgu133A2Expr (41)
Affyhgu133aExpr (72)
Affyhgu133Plus2Expr (58)
affyio (1)
AffymetrixDataTestFiles (74)
Affymoe4302Expr (48)
Affymoe430Expr (1)
affyPLM (1)
AGHmatrix (1)
AgiMicroRna (0)
agricolae (6)
AICcmodavg (1)
AIMS (0)
AIPW (1)
airr (1)
airway (1975)
akima (1)
alabama (1)
alakazam (1)
ald (1)
ALDEx2 (1)
aldvmm (1)
alembic (1)
AlgDesign (1)
alkahest.generic (1)
ALL (3369)
allenpvc (2)
ALLMLL (118)
alluvial (1)
almanac (1)
alphahull (1)
alphashape3d (1)
alpineData (19)
alr4 (1)
altair (1)
amap (1)
AMARETTO (0)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (1)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
AmpAffyExample (40)
ANCOMBC (1)
AneuFinderData (106)
angrycell (1)
animation (2)
annaffy (0)
anndata (1)
annotate (2)
AnnotationDbi (23)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (2)
AnnotationHubData (1)
annotatr (1)
anRichment (1)
anticlust (1)
antiProfilesData (70)
AnVIL (0)
anytime (5)
aod (1)
apcluster (1)
APCtools (1)
ape (20)
apeglm (1)
apex (1)
apexcharter (1)
APL (1)
aplot (36)
appgen (1)
aqp (1)
aracne.networks (51)
archive (1)
ArchR (1)
argparse (10)
argus.DS.Credentials (2)
argusDS.apc.utils (2)
argusDS.backtesting.engine (2)
argusDS.data (2)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (2)
argusDS.data.preparation2 (3)
argusDS.data.visualisation (1)
argusDS.database (1)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (2)
argusDS.distributions (1)
argusDS.driver.importance (2)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamboostLSS (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (2)
argusDS.gamlss.modelling (2)
argusDS.gamlss.smoothers (1)
argusDS.gamlss.testing (3)
argusDS.gamlss.utils (2)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (2)
argusDS.model.validation (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.S3 (1)
argusDS.shiny.utils (2)
argusDS.signal.dataprep (1)
argusDS.smoothers (1)
argusDS.spread.trading.utils (2)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (2)
argusDS.tabulator (1)
argusDS.trading.optimization (1)
argusDS.trading.performance (2)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.UI (1)
argusDS.utilities (1)
aricode (1)
arm (1)
aroma.affymetrix (8)
aroma.apd (8)
aroma.core (8)
aroma.light (0)
ArrayExpress (1)
arrayhelpers (1)
arrayop (1)
arrayQualityMetrics (0)
ARRmData (89)
arrow (18)
arsenal (1)
arules (15)
ArvadosR (1)
arvupload (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ASExtras4 (0)
ash (6)
AshkenazimSonChr21 (20)
ashr (2)
asht (1)
ASICSdata (44)
AsioHeaders (5)
askpass (162)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive (1)
assertive.code (1)
assertive.data (1)
assertive.data.uk (1)
assertive.data.us (1)
assertive.datetimes (1)
assertive.properties (11)
assertive.reflection (1)
assertive.strings (1)
assertive.types (11)
assertr (2)
assertthat (2)
AssessORFData (41)
ASSET (1)
AssotesteR (1)
astsa (1)
ATACseqQC (1)
ATE (1)
ATR (1)
attachment (4)
attempt (1)
AUC (1)
AUCell (1)
audio (1)
audited (1)
av (1)
ava2 (1)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (6)
aws.signature (5)
awsMethods (1)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (1)
AzureGraph (4)
AzureRMR (4)
AzureStor (1)

B

babelgene (3)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
babynames (1)
backbone (1)
backports (56)
BADER (0)
badger (0)
baguette (1)
bain (1)
BalancedSampling (1)
ballgown (0)
bambu (1)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base2grob (1)
base64 (3)
base64enc (2)
base64url (1)
basefun (1)
basemaps (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
basilisk.utils (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
battenberg (1)
BayesFactor (1)
BayesFM (1)
bayesm (9)
bayesmeta (1)
bayesplot (10)
BayesPostEst (1)
bayesQR (1)
bayestestR (3)
BayesX (1)
baySeq (7)
BB (1)
BBmisc (1)
bbmle (9)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bcellViper (580)
bcp (1)
bdsmatrix (7)
BE (1)
beachmat (2)
beadarray (1)
beadarrayExampleData (137)
BeadArrayUseCases (35)
BeadDataPackR (0)
BeadSorted.Saliva.EPIC (20)
beanplot (1)
beepr (1)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkfdrData2019 (20)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
BentoBoxData (0)
berryFunctions (1)
Bessel (1)
bestglm (1)
bestNormalize (2)
beta7 (26)
betareg (1)
bettermc (0)
bezier (1)
BgeeDB (1)
BGLR (1)
BH (152)
BIApylon (1)
BiasedUrn (12)
BIAutils (1)
bibtex (2)
biclust (1)
bife (1)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigdist (1)
BIGL (1)
biglasso (1)
biglm (1)
biglmm (1)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigparallelr (1)
bigreadr (0)
bigrquery (15)
bigsnpr (0)
bigsparser (0)
bigstatsr (1)
bigutils (0)
bigutilsr (1)
billboarder (8)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binman (1)
binom (1)
binr (0)
bio3d (3)
biobank (1)
Biobase (7)
BioBase (1)
bioc::GenomeInfoDbData (0)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (4)
BiocGenerics (28)
BiocInstaller (1)
BiocIO (1)
BiocManager (183)
BiocNeighbors (2)
Bioconductor (1)
BiocParallel (19)
BiocSingular (2)
BiocStyle (1)
BiocVersion (33)
biocViews (1)
BioEnricher (1)
Biogenerics (1)
BioGenerics (1)
BioImageDbs (22)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
BioPlex (24)
biostat3 (1)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostring (1)
Biostrings (15)
biotmleData (57)
biotools (1)
BioVersion (0)
biovizBase (1)
BiplotML (1)
BiRewire (0)
birta (0)
biscuiteerData (86)
bit (58)
bit64 (11)
bitops (13)
bizdays (2)
bkbutils (1)
bladderbatch (587)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blimaTestingData (36)
blme (6)
blob (104)
blockcluster (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
BloodCancerMultiOmics2017 (50)
bluster (0)
BMA (1)
BMisc (1)
bmp (1)
bnlearn (1)
bodymapRat (95)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (37)
Boom (1)
boomer (1)
BoomSpikeSlab (1)
boot (57)
bootstrap (1)
botor (1)
box (8)
bpcp (1)
BradleyTerry2 (1)
brainImageRdata (3)
brave (1)
breakpointRdata (158)
breastCancerMAINZ (96)
breastCancerMKI (0)
breastCancerNKI (93)
breastCancerTRANSBIG (87)
breastCancerUNT (74)
breastCancerUPP (92)
breastCancerVDX (171)
brew (71)
brgedata (61)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (1)
brickster (1)
BridgeDbR (1)
bridgesampling (1)
brio (62)
brms (1)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
bronchialIL13 (29)
broom (103)
broom.helpers (4)
broom.mixed (1)
broomExtra (1)
BrowserViz (1)
bs4Dash (10)
BSgenome (1)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (1)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (2)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomes (1)
bsicons (2)
bslib (270)
bsplus (1)
bsseq (0)
bsseqData (106)
bsts (1)
btergm (1)
bumphunter (1)
butcher (2)
bvls (1)
BWStest (1)

C

C50 (1)
ca (4)
CAbiNet (1)
cache (1)
cachem (160)
cAIC4 (1)
Cairo (23)
calibrate (1)
callr (129)
callthat (1)
CAM (1)
CAMERA (1)
campsis (1)
campsismod (1)
cancerdata (87)
candisc (1)
canvasXpress (1)
caper (1)
capsidr (1)
capushe (1)
car (52)
carData (3)
CardinalWorkflows (82)
caret (46)
caretEnsemble (1)
carrier (1)
casebase (1)
castor (1)
CATALYST (1)
catboost (1)
catdata (1)
Category (1)
caTools (5)
CATT (1)
causaldata (1)
cba (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (106)
ccdrAlgorithm (1)
CCl4 (71)
ccTutorial (39)
cdip.datastore (1)
celarefData (27)
celda (1)
celldex (3090)
CellMapperData (34)
cellranger (1)
cellxgene.census (1)
cem (1)
censored (1)
censReg (1)
CeTF (1)
ceu1kg (9)
ceu1kgv (8)
ceuhm3 (8)
cfToolsData (53)
cgam (1)
cgdsr (1)
cgdv17 (10)
CGHbase (0)
cghMCR (0)
ChAMP (1)
ChAMPdata (620)
champdata (0)
changepoint (1)
chanmetab (1)
charmData (8)
checkmate (147)
checkr (1)
ChemmineOB (1)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
cheung2010 (8)
ChIC.data (25)
chimera (0)
chimeraviz (1)
ChimpHumanBrainData (23)
ChIPComp (0)
chipenrich (0)
chipenrich.data (169)
ChIPexoQualExample (51)
ChIPQC (0)
ChIPseeker (1)
chipseq (0)
chipseqDBData (35)
ChIPseqR (0)
ChIPsim (0)
ChIPXpressData (125)
chk (3)
chopsticks (0)
choroplethr (1)
chroGPS (0)
chromDraw (0)
ChromHeatMap (0)
chromote (6)
chromstaRData (110)
chromVAR (1)
chron (4)
cicero (1)
circlesize (0)
circlize (31)
cisPath (0)
CiteFuse (0)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (78)
ClassDiscovery (1)
classInt (37)
cleanrmd (1)
cleanUpdTSeq (0)
cleaver (0)
cli (238)
CLIFF (1)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (0)
clipper (0)
clipr (30)
cliqueMS (1)
clisymbols (1)
CLL (217)
CLLmethylation (19)
clock (28)
Clomial (0)
Clonality (0)
clonotypeR (0)
clst (0)
clstutils (0)
clubSandwich (1)
clue (44)
CluMSIDdata (47)
cluster (91)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (3)
clustermq (4)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (3)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clusterStab (0)
clusthaplo (0)
clustifyrdatahub (32)
clustMixType (1)
clustree (2)
clv (1)
clValid (1)
CMA (0)
cMap2data (152)
CMAverse (0)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (0)
cn.mops (0)
CNAnorm (0)
CNEr (1)
CNORdt (0)
CNORfeeder (0)
CNORfuzzy (0)
CNORode (0)
CNPBayes (0)
CNTools (0)
cnvGSA (0)
cnvGSAdata (33)
cnvgsadata (0)
CNVPanelizer (0)
CNVrd2 (0)
CNVtools (0)
coastr (1)
cobalt (2)
cobindR (0)
cobs (1)
CoCiteStats (0)
coda (14)
coda.base (1)
codelink (0)
codetools (66)
CODEX (0)
CoGAPS (0)
cogena (0)
cogeqc (1)
coGPS (0)
COHCAP (0)
COHCAPanno (75)
coin (2)
collapse (1)
collections (1)
coloc (16)
colonCA (45)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (10)
colorspace (68)
colortools (1)
colourpicker (9)
colourvalues (1)
cols4all (1)
combinat (1)
coMET (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (155)
compareDF (1)
compareGroups (1)
COMPASS (0)
compcodeR (0)
CompGO (0)
ComplexHeatmap (11)
complexheatmap (0)
ComplexUpset (1)
compositions (3)
CompQuadForm (1)
compute.es (1)
concaveman (1)
condiments (1)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
CONFESSdata (39)
config (20)
configr (1)
confintr (1)
conflicted (12)
confoundr (1)
ConnectivityMap (36)
connectwidgets (1)
conquer (2)
ConsensusClusterPlus (0)
consensusClustR (1)
consort (1)
ConsRank (1)
contentid (1)
contfrac (1)
contingencytables (1)
conumee (0)
convert (0)
coop (1)
copa (0)
COPDSexualDimorphism.data (46)
copula (2)
CopyhelpeR (52)
CopyNeutralIMA (21)
copynumber (1)
CopyNumber450k (0)
CopyNumber450kData (6)
CopywriteR (0)
CoRegNet (1)
Cormotif (0)
CorMut (0)
coRNAi (0)
coro (1)
corpcor (2)
corpora (1)
correlation (1)
CORREP (0)
corrplot (3)
corrr (1)
COSG (1)
CoSIAdata (26)
COSMIC.67 (136)
cosmiq (0)
cosmosR (1)
COSNet (0)
countrycode (11)
coveffectsplot (1)
covr (51)
covRNA (0)
cowplot (59)
coxme (1)
coxphf (1)
CoxPhLb (1)
coxphw (1)
cplm (2)
cpm (1)
cpp11 (207)
cpvSNP (0)
cqn (0)
cranlogs (1)
crayon (109)
crch (1)
CRCL18 (18)
creatr (1)
credentials (39)
crew (3)
crew.cluster (1)
CRImage (0)
CRISPR.shinyapp (1)
crisprScoreData (165)
crlmm (0)
cronR (1)
crop (1)
crossdes (1)
crossmatch (1)
crosstable (1)
crosstalk (131)
crrri (0)
crrry (0)
crul (13)
csaw (0)
CSSP (0)
csv (1)
ctc (0)
cubature (1)
cubelyr (0)
Cubist (1)
cummeRbund (0)
curatedAdipoArray (18)
curatedAdipoChIP (18)
curatedAdipoRNA (20)
curatedBladderData (53)
curatedBreastData (87)
curatedCRCData (31)
curatedMetagenomicData (303)
curatedOvarianData (180)
curatedPCaData (2)
curatedTBData (23)
curatedTCGAData (439)
curl (360)
customProDB (0)
cvar (1)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (0)
cycle (0)
cyclocomp (18)
cyphr (1)
cytofkit (0)
cytolib (1)
CytoMethIC (2)
CytoML (1)
CytoTRACE (1)
CytoTree (1)

D

D2C (1)
d3heatmap (1)
d3r (1)
d3treeR (1)
dada2 (1)
dae (1)
daff (1)
dagitty (1)
dagLogo (0)
DAISIE (1)
DALEX (1)
DALEX2 (1)
daMA (0)
DAPAR (0)
DAPARdata (149)
DART (0)
DASiR (0)
dasnormalize.iomel (1)
dastools (1)
data.table (201)
data.tree (12)
DatabaseConnector (1)
dataCompareR (1)
DataEditR (1)
DataExplorer (1)
dataframes2xls (1)
dataMaid (1)
datamods (6)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datapipeline (1)
datasauRus (1)
DataVisualizations (1)
datawizard (5)
date (1)
DAVIDQuery (0)
davidTiling (25)
dbaccess (1)
dbarts (1)
DBChIP (0)
DBI (157)
DBItest (1)
dblplyr (1)
dbplyr (151)
dbscan (5)
dbx (7)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (0)
ddgraph (0)
debugme (1)
DECIPHER (1)
DeconRNASeq (0)
deconstructSigs (1)
decontam (1)
decor (1)
decoupleR (1)
DEDS (0)
Deducer (1)
deepregression (1)
deepSNV (0)
deeptime (1)
DEGraph (0)
degreenet (1)
DEGseq (0)
Delaporte (1)
DelayedArray (5)
DelayedMatrixStats (11)
deldir (55)
dendextend (50)
DendSer (1)
dendsort (0)
densEstBayes (6)
densityClust (1)
densvis (1)
DEoptim (1)
DEoptimR (26)
DEP (1)
depmap (645)
derfinder (0)
derfinderData (83)
derfinderHelper (0)
Deriv (1)
desc (131)
descr (1)
descsuppR (1)
DescTools (18)
DESeq (0)
DESeq2 (3)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (37)
DeSousa2013 (29)
destiny (0)
devEMF (1)
devtools (46)
devutils (1)
DExMAdata (76)
DEXSeq (1)
dexus (0)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (0)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (5)
DiagrammeRsvg (1)
dials (11)
DiceDesign (7)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (6)
did (1)
DiffBind (1)
diffdf (1)
diffGeneAnalysis (0)
diffHic (0)
DiffLogo (0)
diffloop (1)
diffloopdata (25)
diffobj (11)
diffviewer (1)
digest (305)
diggit (0)
diggitdata (34)
digitalDLSorteR (1)
dimRed (1)
Dino (1)
diptest (2)
directlabels (1)
DirichletMultinomial (1)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distory (1)
distr (1)
distr6 (1)
distributional (12)
DistributionUtils (2)
distro (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1)
DiurnalMRI (1)
dks (0)
DLBCL (100)
dlm (1)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DmelSGI (55)
DMRcaller (0)
DMRcate (0)
DMRcatedata (247)
DMRforPairs (0)
DMwR (1)
DNABarcodes (1)
DNAcopy (0)
DNAZooData (36)
dnet (1)
DO.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (6)
DoE.base (1)
DoEstRare (1)
doFuture (1)
domainsignatures (0)
doMC (2)
doMPI (1)
DonaPLLP2013 (30)
donapllp2013 (0)
doParallel (20)
DOQTL (0)
doRedis (1)
doRNG (4)
dorothea (556)
DOSE (2)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doseR (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (8)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
downlit (35)
downloader (1)
downloadthis (1)
dparser (1)
dplyr (293)
dplyrb (1)
dpplyr (0)
dqrng (38)
drake (9)
drat (1)
drc (1)
DRDID (1)
dream (0)
DREAM4 (10)
dreamerr (1)
dressCheck (31)
drgee (1)
DriverNet (0)
DropletTestFiles (170)
DropletUtils (1)
DRR (1)
DrugVsDisease (0)
DrugVsDiseasedata (132)
dspNgs (0)
dsQTL (9)
DSS (0)
DT (218)
DTA (0)
dtplyr (50)
dttr2 (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (0)
duckdb (2)
duct.tape (1)
DuoClustering2018 (87)
DupChecker (0)
dupRadar (0)
DvDdata (36)
dwrPlus (1)
dyebias (0)
dyebiasexamples (39)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1)
dynfeature (1)
dynlm (1)
dynplot (1)
dynpred (1)
dynsbm (1)
dynwrap (1)

E

e1071 (54)
earth (2)
easierData (162)
easyalluvial (1)
easyENTIM (1)
EasyqpcR (0)
easystats (1)
EatonEtAlChIPseq (37)
ebal (1)
EBarrays (0)
EBcoexpress (0)
EBImage (1)
EBSeq (0)
EBSeqHMM (0)
Ecdat (1)
ecfc (1)
Ecfun (1)
echarts4r (10)
ecodist (1)
ecoliLeucine (44)
ecolitk (0)
ECOSolveR (1)
EDDA (0)
edge (0)
edgeR (10)
effects (1)
effectsize (2)
egg (5)
egor (1)
EGSEAdata (144)
eha (1)
eisa (0)
elasticsearchr (1)
ELBOW (0)
elevatr (2)
ellipse (46)
ellipsis (15)
elliptic (1)
ELMER (1)
ELMER.data (213)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (9)
emdist (1)
EMDomics (0)
emmeans (93)
EMMREML (1)
emtdata (23)
emulator (1)
enc (0)
encode (1)
ENCODEFig4Band4D (1)
encoDnaseI (6)
encryptr (1)
energy (1)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (0)
english (1)
enhancedvolcano (0)
EnhancedVolcano (1)
EnrichedHeatmap (1)
enrichplot (2)
enrichPlot (1)
enrichR (2)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (1)
EnsDb.Hsapiens.v86 (1)
ensembldb (1)
ensemblVEP (0)
entropy (2)
envalysis (1)
ENVISIONQuery (0)
EnvStats (2)
Epi (1)
epigenomix (0)
EpiMix.data (68)
epimutacionsData (86)
epiR (3)
EpiStats (1)
epitools (1)
eq5d (1)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
erccdashboard (0)
ergm (1)
ergm.multi (1)
erify (1)
erma (0)
errorlocate (1)
escape (1)
ESNSTCC (0)
esquisse (2)
estimability (15)
estimatr (1)
estmeansd (1)
estrogen (87)
etec16s (19)
etm (1)
eudysbiome (0)
eulerr (1)
europepmc (1)
evaluate (335)
EValue (1)
evd (1)
eventTrack (1)
ewceData (177)
ewfutils (1)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (2)
excelR (1)
ExiMiR (0)
exomeCopy (0)
ExomeDepth (1)
ExperimentHub (1)
ExperimentHubData (1)
expint (1)
explorase (0)
explore (1)
ExploreModelMatrix (0)
ExplorOMICS (1)
expm (19)
ExpressionView (0)
expss (6)
extraChIPs (1)
extraDistr (6)
extrafont (3)
extrafontdb (1)
extraInserts (1)
extraoperators (1)
extraTrees (0)

F

faahKO (282)
fabia (0)
fabiaData (23)
fable (1)
fabletools (1)
facopy.annot (3)
facsDorit (9)
factDesign (0)
factoextra (3)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (42)
Factoshiny (1)
fairhub.r.client (1)
fakepackage (1)
fansi (254)
FANTOM3and4CAGE (42)
faraway (1)
farms (0)
farver (37)
fastcluster (5)
fastDummies (23)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (8)
fastmap (77)
fastmatch (25)
fastmatrix (1)
fastqcr (1)
fastreeR (1)
fastseg (0)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
faux (1)
fauxpas (1)
fBasics (2)
fCI (0)
FD (1)
fda (9)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (0)
fdrame (0)
fdrtool (3)
fds (5)
feather (1)
feature (6)
FedData (1)
feisr (1)
FEM (0)
fenr (1)
fExtremes (4)
ff (33)
ffpe (0)
ffpeExampleData (43)
fftw (1)
fftwtools (1)
fGarch (4)
FGNet (0)
fgsea (1)
fibroEset (85)
fido (1)
FieldEffectCrc (18)
fields (5)
filehash (0)
filelock (58)
filesstrings (1)
finalfit (1)
FindMyFriends (0)
findpython (10)
finetune (1)
fingerprint (1)
FIs (68)
FISHalyseR (0)
fission (234)
fit.models (1)
fitdistrplus (30)
fixest (1)
flagme (0)
flair (1)
flashClust (1)
Fletcher2013a (83)
Fletcher2013b (64)
flexclust (1)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (21)
flipflop (0)
float (1)
flock (1)
flowAI (1)
flowBeads (0)
flowBin (0)
flowcatchR (0)
flowCHIC (0)
flowCL (0)
flowClean (0)
flowClust (1)
flowCore (0)
FlowCore (1)
flowCyBar (0)
flowDensity (0)
flower (1)
flowFit (0)
flowFitExampleData (8)
flowFP (0)
flowMap (0)
flowMatch (0)
flowMeans (0)
flowMerge (0)
flowPeaks (0)
flowPloidyData (49)
flowPlots (0)
flowQB (0)
flowQBData (3)
FlowRepositoryR (0)
FlowSOM (1)
FlowSorted.Blood.450k (303)
FlowSorted.Blood.EPIC (183)
FlowSorted.CordBlood.450k (41)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (46)
FlowSorted.CordBloodNorway.450k (26)
FlowSorted.DLPFC.450k (148)
flowStats (1)
flowTrans (0)
flowType (0)
flowUtils (0)
flowViz (0)
flowVS (0)
flowWorkspace (0)
flowWorkspaceData (153)
flux (1)
fmcsR (0)
FME (1)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (76)
focalCall (0)
foghorn (1)
fontawesome (127)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (23)
foreach (8)
forecast (5)
foreign (50)
forestmodel (1)
forestplot (1)
forestploter (1)
fork (1)
formatR (59)
formattable (1)
formatters (2)
Formula (15)
formula.tools (1)
forrester.metadata (0)
fortunes (1)
FourCSeq (0)
fourDNData (35)
fpc (2)
fracdiff (3)
FragPipeAnalystR (1)
FRASER (0)
freetypeharfbuzz (1)
fresh (6)
FrF2 (1)
FRGEpistasis (0)
frma (0)
frmaExampleData (46)
frmaTools (0)
fs (217)
FSA (1)
fst (1)
fstcore (1)
fTrading (1)
fucci (0)
FunciSNP (0)
FunciSNP.data (8)
fungible (1)
funkyheatmap (1)
furrowSeg (22)
furrr (18)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (148)
future.apply (114)
future.batchtools (1)
future.callr (4)
fuzzyjoin (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (30)
gaga (0)
gage (0)
gageData (306)
gaggle (0)
gaia (0)
gam (7)
GAMBLR.results (1)
GAMBoost (1)
gamboostLSS (2)
gameofthrones (1)
gamlss (3)
gamlss.add (1)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (3)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (85)
gaschYHS (21)
gaston (1)
GastrographPackage (1)
gatingMLData (11)
gaucho (0)
gausscov (1)
gbm (35)
gbRd (1)
gbutils (1)
gcatest (0)
gclus (1)
gCMAP (0)
gCMAPWeb (0)
gcrma (0)
gcspikelite (100)
gdata (18)
gDNAinRNAseqData (47)
gDRtestData (42)
gdsfmt (1)
gdsx (1)
gdtools (41)
gee (1)
geecc (0)
geepack (5)
geigen (1)
gemma.R (0)
gemtc (1)
GenABEL (2)
GenABEL.data (2)
genArise (0)
GENE.E (0)
GeneAnswers (0)
GeneBreak (0)
GeneExpressionSignature (0)
genefilter (1)
genefu (0)
geneLenDataBase (1529)
genelendatabase (0)
GeneMeta (0)
GeneNetworkBuilder (0)
GeneOverlap (0)
geneplotter (1)
GeneralizedHyperbolic (2)
geneRecommender (0)
GeneRegionScan (0)
generics (40)
geneRxCluster (0)
GeneSelectMMD (0)
GeneSelector (0)
GENESIS (0)
geNetClassifier (0)
genetics (1)
GeneticsDesign (0)
GeneticsPed (0)
GENIE3 (0)
genoCN (0)
genomationData (81)
GenomeGraphs (0)
GenomeInfoDb (18)
GenomeInfoDbData (5)
genomeIntervals (0)
GenomicAlignments (2)
GenomicDistributionsData (71)
GenomicFeatures (11)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (1)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (2)
GenomicFiles (1)
GenomicRanges (3)
GenomicTools (1)
GenomicTuples (0)
Genominator (0)
genoset (0)
genotypeeval (0)
GenoView (0)
GenSA (2)
geobr (1)
geodata (1)
geodiv (1)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonlint (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (7)
GEOmetadb (0)
geometries (15)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (0)
GEOquery (1)
geoR (1)
geos (1)
geosphere (11)
GEOsubmission (0)
GeoTcgaData (1)
gert (61)
gespeR (0)
gestalt (7)
gestate (1)
getip (1)
getopt (22)
GetoptLong (3)
getPass (2)
gettz (1)
GeuvadisTranscriptExpr (39)
geuvPack (3)
geuvStore (2)
geuvStore2 (4)
GEWIST (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (17)
ggalt (1)
gganimate (1)
GGBase (0)
ggbeeswarm (18)
ggbio (0)
ggbreak (1)
ggchicklet (0)
ggcorrplot (2)
ggdag (1)
GGdata (10)
ggdendro (11)
ggdensity (1)
ggdist (3)
gge (1)
ggeasy (1)
ggedit (1)
ggeffects (2)
ggExtra (5)
ggfittext (2)
ggforce (20)
ggformula (31)
ggfortify (2)
ggfun (41)
gggenes (1)
ggh4x (2)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (4)
ggiraphExtra (1)
ggm (1)
ggmap (33)
ggmosaic (1)
ggmsa (1)
ggnetwork (1)
ggnewscale (33)
ggnewscales (1)
ggokabeito (1)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (272)
ggplot2movies (1)
ggplotify (30)
ggpmisc (4)
ggPMX (1)
ggpointdensity (6)
ggpp (6)
ggprism (1)
ggpubr (22)
ggRandomForests (0)
ggrap2 (1)
ggraph (12)
ggrastr (10)
ggrepel (178)
ggridges (43)
ggsci (58)
ggseqlogo (11)
ggside (3)
ggsignif (11)
ggspatial (1)
ggstance (1)
ggstats (2)
ggstatsplot (2)
ggsurvfir (0)
ggsurvfit (1)
ggtern (6)
ggtext (2)
ggthemes (10)
ggtree (13)
ggtreeDendro (1)
ggtreeExtra (1)
ggtut (7)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (2)
ggwordcloud (1)
gh (58)
ghpm (1)
ghql (1)
gifski (1)
GIGSEAdata (15)
Giotto (1)
git2r (33)
gitcreds (19)
gitlabr (1)
gittargets (1)
GLAD (1)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
glmGamPoi (1)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (0)
glmmML (1)
glmmTMB (3)
glmnet (21)
glmnetUtils (7)
glmperm (1)
glmx (1)
GlobalAncova (0)
GlobalOptions (1)
globals (41)
globals, (1)
globaltest (0)
glpkAPI (1)
glue (106)
gmailr (1)
gMCP (1)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (2)
gmnl (1)
gmodels (2)
gmp (14)
gmthemes (1)
gnm (1)
GO.db (3)
godmode (1)
goftest (13)
GOFunction (0)
golem (5)
golubEsets (230)
golubesets (0)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (69)
googlesheets4 (77)
googleVis (2)
GOSemSim (1)
goseq (0)
goshawk (1)
GOstats (1)
gower (13)
gpaExample (31)
GPArotation (34)
GPfit (1)
gplots (62)
gprofiler2 (2)
gRain (1)
gralarkivar (1)
granny (1)
graph (1)
GraphGallery (1)
graphiQs (1)
graphite (0)
graphlayouts (40)
graphql (1)
gRbase (1)
greekLetters (1)
Greg (1)
greybox (1)
grf (1)
grid (1)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (2)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (2)
grImport (1)
grImport2 (1)
grndata (37)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
GSA (1)
gsbDesign (1)
GSBenchMark (61)
gscounts (1)
gsDesign (1)
GSE103322 (37)
GSE13015 (31)
GSE159526 (16)
GSE62944 (61)
GSEABase (1)
GSEAbase (1)
gsignal (1)
gskb (4)
gsl (3)
gsmoothr (5)
gson (6)
gsrc (0)
gss (3)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (1)
GSVAdata (635)
gt (11)
gtable (174)
gtExtras (0)
gto (1)
gtools (57)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (1)
GUniFrac (2)
gupio (1)
Gviz (1)
GWASdata (85)
GWASExactHW (5)
gwasrapidd (1)
GWASTools (0)
GWENA (1)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)

H

h2o (4)
h5vcData (131)
HAC (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
haplo.stats (1)
HaploSim (1)
haplotrackR (1)
hapmap100khind (25)
hapmap100kxba (46)
hapmap500knsp (33)
hapmap500ksty (41)
hapmapsnp5 (113)
hapmapsnp6 (145)
harbChIP (26)
hardhat (59)
HardyWeinberg (1)
HarmanData (40)
HarmonizedTCGAData (27)
harmony (8)
hash (2)
haven (94)
HCAData (83)
HCATonsilData (22)
HD2013SGI (45)
HDCytoData (173)
HDF5Array (10)
hdf5r (7)
hdi (1)
HDInterval (10)
hdnom (1)
HDO.db (1)
hdrcde (6)
healthyControlsPresenceChecker (15)
healthyFlowData (43)
heatmap.plus (1)
heatmaply (18)
HEEBOdata (36)
heemod (1)
HelloRangesData (69)
heplots (1)
here (2)
Herper (1)
hexbin (15)
hexSticker (1)
hexView (1)
hgu133a.db (0)
hgu133abarcodevecs (18)
hgu133afrmavecs (2)
hgu133plus2.db (0)
hgu133plus2barcodevecs (16)
hgu133plus2CellScore (32)
hgu133plus2frmavecs (2)
hgu2beta7 (17)
hgu95a.db (1)
HiBED (9)
HiCBricks (0)
HiCDataHumanIMR90 (52)
HiCDataLymphoblast (39)
HiClimR (1)
HiContactsData (101)
hierfstat (0)
highcharter (1)
highlight (0)
HighlyReplicatedRNASeq (17)
highr (66)
highs (1)
Hiiragi2013 (103)
HIVcDNAvantWout03 (18)
Hmisc (31)
HMP16SData (37)
HMP2Data (36)
hms (115)
hmyriB36 (9)
Homo.sapiens (0)
homosapienDEE2CellScore (0)
Hoover (1)
hopach (0)
hrbrthemes (1)
HSAUR2 (1)
HSAUR3 (1)
hsm (0)
HSMMSinglece11 (1)
HSMMSinglecel1 (0)
HSMMSingleCell (2740)
htmlTable (25)
htmltools (319)
htmlwidgets (244)
HTqPCR (1)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (9)
httptest2 (1)
httput (1)
httpuv (265)
httr (232)
httr2 (84)
huge (1)
HumanAffyData (31)
humanStemCell (125)
hunspell (5)
huxtable (2)
hwriter (3)
hydroPSO (1)
hypergate (1)
hypergeo (1)
hypred (1)

I

IAPWS95 (1)
iatlas.app (1)
iatlasGraphQLClient (1)
iBreakDown (1)
ica (15)
icenReg (1)
Icens (1)
ICS (1)
ICSNP (1)
ICSOutlier (1)
IDPmisc (3)
idr (0)
ids (1)
ifnb.SeuratData (1)
iGasso (1)
igraph (151)
igraphdata (1)
igvShiny (1)
iheatmapr (5)
IHW (1)
IHWpaper (34)
ijtiff (1)
Illumina450ProbeVariants.db (536)
IlluminaDataTestFiles (80)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (0)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (2)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (1)
illuminaio (1)
imager (2)
imbalance (1)
imcdatasets (62)
imcRtools (0)
iml (0)
immunarch (1)
import (3)
ImpulseDE2 (1)
impute (1)
imputeLCMD (1)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
IncidencePrevalence (1)
ind1KG (6)
iNEXT (1)
infer (12)
infercnv (1)
influenceR (4)
InformationValue (1)
infotheo (2)
ingredients (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (20)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
InraeThemes (1)
insight (7)
installr (1)
intamap (1)
intansv (0)
interactiveDisplayBase (1)
interactomes (1)
intergraph (1)
interp (15)
interval (1)
intervals (4)
inum (3)
invgamma (1)
iontreeData (6)
iotools (1)
ipaddress (1)
ipcwswitch (1)
IPDfromKM (1)
ipred (45)
ips (1)
iptmnetr (1)
ipw (1)
iq (1)
IRanges (19)
IRdisplay (1)
IRkernel (1)
irlba (31)
irr (1)
ISLR (1)
Iso (1)
isoband (66)
ISOcodes (1)
isva (5)
ISwR (1)
ITALICSData (53)
iterators (8)
itertools (1)
itsadug (1)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
Iyer517 (21)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (3)
janitor (4)
JASPAR2014 (85)
JASPAR2016 (165)
JavaGD (1)
JBrowseR (1)
jcolors (1)
JctSeqData (5)
jctseqdata (0)
JGR (1)
JM (1)
JMbayes (1)
jnjtemplates (1)
JohnsonKinaseData (2)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (14)
jqr (9)
jquerylib (2)
js (1)
jskm (1)
jsonify (1)
jsonlite (280)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)

K

kableExtra (14)
kangar00 (1)
KaryoploteR (0)
karyoploteR (1)
katex (1)
KEGG.db (1)
KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (91)
KEGGdzPathwaysGEO (285)
KEGGgraph (1)
keggorthology (0)
KEGGprofile (0)
KEGGREST (10)
keggsvg (1)
Kendall (1)
keras (8)
KernelKnn (1)
kernlab (5)
KernSmooth (68)
keyring (6)
KFAS (1)
khroma (1)
kidpack (23)
kinship2 (1)
kit (1)
kknn (1)
klaR (2)
km.ci (2)
kmed (1)
kml (1)
kml3d (1)
KMsurv (1)
knitr (272)
knitrdata (1)
knockoff (1)
KOdata (97)
kohonen (2)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (7)
kSamples (1)
ktplots (1)
kutils (1)
kyotil (1)

L

L1pack (1)
l2p (1)
labdsv (1)
labeling (145)
labelled (5)
laeken (2)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (2)
lamW (3)
landscapemetrics (1)
languageserver (2)
LaplacesDemon (1)
lares (1)
lars (1)
lasso2 (1)
lastdose (1)
latentnet (1)
later (224)
latex2exp (1)
lattice (166)
latticeExtra (12)
lava (41)
lavaan (42)
lavaSearch2 (1)
lazy (1)
lazyeval (21)
lbaQcCheck (1)
LBE (1)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
ldap (1)
LDheatmap (1)
LDlinkR (1)
LDplots (1)
LEA (1)
leafem (1)
leaflegend (1)
leaflet (4)
leaflet.minicharts (1)
leaflet.providers (2)
leafpop (1)
leaps (1)
LearnBayes (1)
learnr (6)
leeBamViews (61)
leiden (33)
leidenAlg (1)
leidenbase (17)
lemon (2)
leukemiasEset (124)
leukemiaseset (1)
lfa (1)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (10)
liana (0)
libcoin (3)
libgeos (1)
LiblineaR (10)
libr (1)
LiebermanAidenHiC2009 (23)
lifecycle (191)
liftOver (1)
lightgbm (1)
limma (97)
limmaGUI (0)
limmia (1)
limSolve (1)
LinMod2 (1)
Linnorm (1)
linprog (1)
lintr (40)
listenv (50)
ListerEtAlBSseq (25)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lm.beta (1)
lme4 (139)
lmerTest (1)
lmodel2 (1)
lmom (13)
lmomco (1)
Lmoments (1)
lmtest (16)
lobstr (3)
locfit (87)
log4r (3)
logcondens (1)
logger (4)
logging (1)
LogicReg (1)
logistf (10)
logitnorm (1)
logitr (1)
logr (1)
logrrr (1)
logspline (1)
lokern (1)
longitudinalData (1)
loo (10)
LoomExperiment (1)
lotri (1)
LowRankQP (1)
lpridge (1)
lpSolve (16)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1)
lqmm (1)
LRcellTypeMarkers (44)
lsa (8)
lsei (1)
lsmeans (1)
lubridate (82)
lumi (0)
lumiBarnes (51)
Luminescence (1)
LungCancerACvsSCCGEO (63)
LungCancerLines (67)
lungExpression (64)
lvec (1)
lwgeom (2)
lydata (125)
lymphoma (1)

M

m03modeldevelopment (1)
M3DExampleData (69)
M3Drop (1)
Maaslin2 (1)
maboost (1)
macrophage (254)
MACSdata (40)
MACSr (1)
maditr (1)
madness (1)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (2)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (2)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (1)
maftools (1)
magic (1)
magicaxis (1)
magick (14)
magrittr (31)
maic (1)
maicChecks (1)
mailR (0)
MAIT (0)
makecdfenv (0)
maketools (13)
MALDIquant (3)
mammaPrintData (30)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mAPKLData (19)
mapplots (1)
mapproj (1)
maps (11)
maptools (19)
maptree (1)
mapview (1)
maqcExpression4plex (45)
MAQCsubset (42)
MAQCsubsetAFX (9)
MAQCsubsetILM (20)
marginaleffects (1)
margins (1)
marinerData (54)
Markdown (0)
markdown (99)
markovchain (1)
marqLevAlg (1)
marray (0)
maSigPro (0)
MASS (238)
MassSpecWavelet (1)
MAST (1)
Matching (1)
MatchIt (2)
MatchThem (1)
mathjaxr (2)
matlib (1)
Matrix (317)
Matrix.utils (7)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixExtra (1)
MatrixGenerics (3)
MatrixModels (104)
matrixStats (185)
matrixTests (1)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (6)
mbend (1)
MBESS (1)
mboost (2)
mc2d (1)
MCAData (0)
mclogit (1)
mclust (14)
mclustcomp (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (2)
MCMCprecision (1)
MCPcounter (0)
mcr (8)
mCSEAdata (123)
mcsurvdata (19)
mctq (1)
mda (1)
MEALData (3)
measurements (1)
measures (1)
mediation (1)
MEDIPSData (59)
MEEBOdata (37)
memisc (1)
memoise (17)
MEMSS (1)
memuse (1)
MendelianRandomization (1)
merDeriv (1)
MerfishData (29)
merTools (1)
MeSHDbi (1)
MESS (1)
meta (1)
Metab (0)
metabaser (1)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
MetaboAnalystR (1)
metabolomics (1)
MetaboReport (1)
metacore (1)
metadat (1)
metafor (3)
metagenomeSeq (0)
MetaGxBreast (28)
MetaGxOvarian (26)
MetaGxPancreas (23)
metaMA (8)
metaMS (0)
metaMSdata (77)
metap (9)
metaplot (1)
metaplus (1)
metapod (1)
MetaScope (19)
metatools (1)
MetaUtility (1)
methyAnalysis (0)
MethylAidData (59)
methylclock (1)
methylclockData (162)
MethylMix (0)
MethylSeqData (18)
methylumi (0)
methyvimData (4)
metR (1)
metrumrg (1)
mets (1)
mev (1)
mFilter (1)
Mfuzz (0)
mfx (1)
mgcv (250)
mgm (1)
mhsmm (1)
mhurdle (1)
mia (1)
miaViz (1)
mice (13)
miceadds (1)
microbenchmark (1)
MicrobiomeBenchmarkData (27)
microbiomeDataSets (139)
micromap (1)
microRNAome (22)
microseq (1)
Microsoft365R (1)
MIGSAdata (13)
miloR (1)
mime (44)
mimosa (1)
minet (0)
minfi (1)
minfiData (418)
minfiDataEPIC (99)
minionSummaryData (47)
miniUI (1)
minpack.lm (3)
minqa (88)
mirai (2)
miRcompData (61)
miRNATarget (51)
mirt (18)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (2)
missRanger (1)
misty (1)
mitml (1)
mitoODEdata (7)
mitools (1)
mixOmics (1)
mixsqp (18)
mixtools (1)
mixture (1)
MKmisc (1)
mlbench (10)
MLEcens (1)
mlegp (1)
mlfa (1)
mlflow (1)
MLmetrics (1)
mlmm.gwas (1)
mlmRev (1)
mlogit (1)
mlpack (1)
mlr (1)
mlr3 (2)
mlr3cluster (1)
mlr3data (1)
mlr3filters (1)
mlr3fselect (1)
mlr3hyperband (1)
mlr3learners (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (2)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (1)
mlr3spatiotempcv (1)
mlr3tuning (1)
mlr3tuningspaces (1)
mlr3viz (1)
mlt (1)
mma (1)
MMAPPR2data (41)
MMDiffBamSubset (44)
mmrm (38)
mnormt (14)
MNP (1)
mockery (4)
mockr (1)
modelbased (1)
modeldata (12)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (51)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltime.ensemble (1)
modeltools (1)
modetest (1)
MODIStsp (2)
modules (5)
MOFA2 (0)
MOFAdata (163)
moleculaR (1)
moments (2)
Momocs (1)
monaLisa (1)
mondate (1)
monkey (1)
monocle (1)
monocle3 (1)
MonoPhy (1)
morpheus (1)
Morpho (1)
mosaic (1)
mosaicCore (30)
mosaicData (1)
mosaicsExample (85)
motifmatchr (1)
mouse4302barcodevecs (17)
mouse4302frmavecs (2)
MouseAgingData (2)
mousecortexref.SeuratData (1)
MouseGastrulationData (148)
MouseThymusAgeing (59)
MPA (1)
MplusAutomation (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (1)
MPV (1)
mratios (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (1)
msatR (1)
MSBdata (4)
MsCoreUtils (1)
msd16s (42)
msdata (529)
MsFeatures (0)
msigdb (517)
msigdbr (3)
msm (6)
MSMB (65)
MSnbase (1)
msPurityData (44)
msqc1 (18)
MSstats (1)
MSstatsBioData (4)
MSstatsLiP (1)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (1)
mstate (1)
MSwM (1)
mtbls2 (63)
MTseekerData (3)
MUGAExampleData (35)
muhaz (1)
Mulder2012 (8)
muleaData (1)
multcomp (40)
multcompView (38)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (1)
multicool (5)
multicross (1)
multidplyr (0)
multiGSEA (1)
multimode (1)
multinichenetr (0)
multinma (1)
multipanelfigure (2)
multiwayvcov (1)
multiWGCNAdata (8)
multtest (1)
MuMIn (1)
munsell (19)
muscat (1)
muscData (152)
muscle (0)
MutationalPatterns (0)
mutoss (9)
mvabund (1)
mvna (1)
mvnfast (0)
mvnormtest (1)
mvoutData (39)
mvtnorm (115)
mycor (1)
mygene (0)
myphd (1)
mzID (0)
mzR (1)

N

n1qn1 (1)
nabor (1)
NACHO (1)
NADA (5)
name (1)
naniar (1)
nanoarrow (1)
nanonext (2)
NanoporeRNASeq (54)
NanoPyx (1)
NanoStringNCTools (0)
nanostringr (1)
nanotime (1)
nanotubes (28)
narray (1)
nasapower (1)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
ncappc (1)
ncar (1)
ncdf4 (9)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1)
NCIgraphData (21)
ncigraphdata (1)
NCmisc (2)
ncvreg (1)
ndexr (0)
ndjson (0)
Nebulosa (1)
neo2R (1)
NEONiso (1)
neonUtilities (1)
nephro (1)
nestcolor (1)
nestedcv (1)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
NestLink (22)
NetActivityData (53)
NetBID2 (0)
netDx.examples (1)
netmeta (1)
netrankr (1)
NetSwan (1)
network (2)
networkD3 (1)
networkDynamic (1)
neuralnet (1)
NeuralNetTools (1)
Neve2006 (33)
nFactors (1)
NGScopyData (50)
ngsReports (1)
NHANES (1)
nhanesA (1)
nimble (1)
nipals (1)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (1)
nlme (206)
nlmeODE (1)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (1)
nloptr (43)
nls2 (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (12)
NMproject (1)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (80)
NNLM (1)
nnls (4)
noctua (1)
NOISeq (0)
NonCompart (1)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (2)
norm (3)
NormalizerDE (1)
NormalyzerDE (1)
NORMT3 (1)
nortest (1)
Nozzle.R1 (1)
npde (1)
nphRCT (1)
npsurv (1)
nullrangesData (167)
numbat (7)
numbers (1)
numDeriv (2)
NxtIRFdata (92)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
ObMiTi (17)
oct4 (38)
octad.db (53)
od (1)
odbc (22)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (20)
oligo (0)
oligoClasses (0)
OlinkAnalyze (1)
olsrr (1)
OmicCircos (0)
omicsbase (0)
OMICsPCAdata (82)
omnibus (1)
OmnipathR (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
OnassisJavaLibs (32)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oncomarkerbase (1)
oneChannelGUI (0)
ontologyIndex (18)
ontologyPlot (1)
ontoProc (1)
oompaBase (3)
oompaData (3)
opdisDownsampling (1)
openCyto (1)
openeo (1)
OpenMx (1)
openssl (310)
openxlsx (25)
openxlsx2 (1)
operator.tools (1)
optextras (1)
optimalFlowData (66)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (15)
optmatch (1)
optparse (43)
optpart (1)
optweight (1)
orca (1)
OrderedList (0)
ordinal (2)
ore (1)
org.Ag.eg.db (1)
org.At.tair.db (1)
org.Dm.eg.db (0)
org.Dr.eg.db (1)
org.Hs.eg.db (4)
org.Mm.eg.db (2)
org.Pf.plasmo.db (1)
org.Rn.eg.db (0)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (0)
OrganismDbi (1)
oricvis (1)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (1)
orthopolynom (1)
orthosData (53)
oskeyring (1)
osmdata (31)
osprey (1)
osqp (2)
outliers (1)
overlapping (1)

P

PAA (0)
packer (1)
packrat (43)
pacman (1)
padr (1)
pagedown (1)
pagoda2 (1)
PAIRADISE (1)
PairedData (1)
pak (2)
paletteer (5)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (2)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (2)
pander (3)
pandoc (1)
panelr (1)
paquet (1)
paradox (1)
parallelly (132)
parallelMap (1)
param6 (1)
parameters (4)
ParamHelpers (0)
parathyroid (4)
parathyroidSE (306)
parcats (1)
parsedate (3)
parsnip (13)
partitions (1)
party (2)
partykit (3)
pasilla (903)
pasillaBamSubset (312)
PasillaTranscriptExpr (44)
PASWR (1)
patch (1)
patchwork (70)
pathfindR (1)
pathfindR.data (1)
pathifier (0)
PathNetData (39)
pathprintGEOData (4)
pathview (1)
patientProfilesVis (1)
patrick (1)
paws (17)
paws.analytics (17)
paws.application.integration (17)
paws.common (54)
paws.compute (17)
paws.cost.management (17)
paws.customer.engagement (17)
paws.database (17)
paws.developer.tools (11)
paws.end.user.computing (11)
paws.machine.learning (17)
paws.management (17)
paws.networking (17)
paws.security.identity (17)
paws.storage (52)
pbapply (53)
pbdZMQ (2)
PBIR (0)
pbivnorm (1)
pbkrest (0)
pbkrtest (62)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
PBSddesolve (1)
PBSmapping (1)
pbv (1)
pcaExplorer (0)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (9)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (8)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (8)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
pcaPP (15)
PCAtools (1)
PCDimension (1)
pch (1)
PCHiCdata (47)
PCICt (1)
pcse (1)
pcxnData (54)
pd.atdschip.tiling (30)
pdfCluster (1)
pdftools (9)
pdist (1)
pdp (1)
pec (1)
pedigree (1)
pedigreemm (1)
pedtools (1)
pegas (1)
pegboard (1)
PEIP (1)
PEMM (1)
penalized (1)
pepDat (39)
PepsNMRData (45)
Peptides (1)
performance (5)
PerformanceAnalytics (1)
periscope (1)
perm (7)
permimp (1)
permute (3)
PFAM.db (0)
PFIM (1)
pgirmess (1)
PGPC (3)
PGSEA (0)
phangorn (3)
pharmaRTF (1)
pharmaversesdtm (1)
phastCons100way.UCSC.hg19 (2)
pheatmap (1)
philentropy (2)
phonTools (1)
phosphoricons (5)
PhosR (0)
phyclust (1)
phylobase (1)
phylocanvas (1)
phylogram (1)
phylolm (1)
PhyloProfileData (18)
phyloseq (1)
phylosignal (1)
phylotools (1)
phyr (1)
phytools (5)
picante (1)
piggyback (1)
pillar (154)
pimeta (1)
pinfsc50 (1)
pingr (10)
pins (39)
pipeR (1)
piton (1)
pixmap (2)
PK (1)
pkbrtest (1)
pkgbuild (114)
pkgcache (9)
pkgconfig (3)
pkgdepends (10)
pkgdown (20)
pkgKitten (1)
pkglite (1)
pkgload (232)
pkgmaker (2)
pkgpub (1)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDdatasets (1)
PKPDmodels (1)
PKreport (1)
planet (1)
plantecophys (1)
plasFIA (6)
plier (0)
plm (1)
plogr (1)
plot3D (2)
plotfunctions (1)
plotgardener (0)
plotgardenerData (83)
plotly (156)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (1)
plotmo (1)
plotrix (12)
plotROC (1)
pls (3)
plumber (6)
plyr (154)
plyranges (1)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmml (1)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (52)
pointblank (1)
PoissonBinomial (1)
poLCA (1)
polspline (3)
Polychrome (1)
polyclip (85)
polycor (1)
polyester (0)
polynom (4)
PolynomF (1)
polysat (0)
pool (5)
poolfstat (1)
poorman (2)
PopED (1)
poppr (1)
PossibilityCurves (2)
posterior (10)
PowerExplorer (1)
poweRlaw (7)
powerTCR (1)
PowerTOST (1)
powsimR (1)
ppcor (1)
ppiData (11)
prabclus (2)
pracma (25)
prada (1)
praise (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebsdata (56)
PreciseSums (1)
preciseTADhub (17)
precommit (1)
PREDAsampledata (60)
prediction (1)
predint (1)
PReMiuM (1)
preproc.iquizoo (1)
preprocessCore (1)
preprocessorCore (1)
presser (1)
presto (1)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettymapr (1)
prettyunits (159)
princurve (1)
printr (1)
prioritylasso (1)
prismatic (1)
PRISMselector (1)
pROC (60)
processCore (0)
processx (255)
ProData (24)
prodlim (57)
productplots (1)
proffer (1)
profile (0)
profileModel (1)
profmem (1)
profvis (37)
ProgMan (1)
progress (77)
progressr (56)
proj (0)
PROJ (5)
proj4 (18)
ProjecTILs (1)
projpred (1)
pRolocdata (232)
promise (1)
promises (143)
prompt (1)
prompter (1)
propr (1)
PROreg (1)
prostateCancerCamcap (24)
prostateCancerGrasso (21)
prostateCancerStockholm (16)
prostateCancerTaylor (20)
prostateCancerVarambally (17)
proteomixr (1)
ProtGenerics (1)
proto (1)
protolite (1)
protr (9)
protti (1)
protViz (1)
proxy (3)
proxyC (2)
PRROC (5)
pryr (10)
ps (248)
PSCBS (7)
pscl (2)
PsNR (1)
pspearman (1)
pspline (1)
psych (75)
psychometric (6)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
ptairData (55)
PtH2O2lipids (36)
ptw (1)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
pulsar (1)
pumadata (48)
PupillometryR (1)
PureCN (0)
purrr (172)
purrrlyr (1)
purrrr (1)
pvca (1)
pvclust (1)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (37)
PWMEnrich.Hsapiens.background (41)
PWMEnrich.Mmusculus.background (33)
pwr (1)
pwrEWAS.data (28)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (11)
qbaDatabase (1)
qcc (1)
qclMatrix (1)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq.hg19 (141)
QDNAseq.mm10 (69)
qgam (1)
qgraph (2)
qicharts (1)
qlcMatrix (13)
qpcR (1)
qpdf (3)
qPLEXdata (39)
qqconf (9)
qqman (3)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qs (9)
QSARdata (1)
qtl (1)
qtl2 (1)
quadprog (2)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantmod (11)
quantreg (76)
quantsmooth (1)
quarto (5)
QUBICdata (39)
questionr (2)
QuickJSR (1)
qvalue (1)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)

R

r (1)
R.cache (2)
R.devices (8)
R.filesets (8)
R.huge (5)
R.methodsS3 (15)
R.oo (48)
R.rsp (1)
R.utils (113)
R2admb (1)
r2d2 (1)
r2d3 (1)
R2GUESS (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (1)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R6 (52)
rAccess (1)
radarchart (1)
radiant (1)
radiant.data (1)
radiant.model (1)
radiator (1)
raerdata (26)
ragg (119)
rainbow (9)
rAmCharts (1)
RamiGO (0)
randomcoloR (5)
RandomFields (0)
RandomFieldsUtils (0)
randomForest (2)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randomNames (1)
randtoolbox (1)
ranger (13)
RankAggreg (1)
RankProd (0)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (6)
rappdirs (9)
rapportools (2)
rARPACK (5)
raster (50)
rasterVis (1)
ratelimitr (1)
RAthena (10)
rayimage (1)
rayrender (1)
rayvertex (1)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (47)
rbioapi (3)
rBLAST (1)
rbmi (1)
rbokeh (1)
rcartocolor (1)
rcdk (10)
rcdklibs (10)
rcellminerData (75)
Rcgmin (1)
Rchoice (1)
RCircos (0)
RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp (71)
RClickhouse (1)
rclipboard (5)
rcmdcheck (30)
Rcmdr (1)
RcmdrMisc (2)
RColorBrewer (17)
rcompanion (1)
rcorpora (1)
Rcpp (271)
rcpp (1)
RcppAlgos (1)
RcppAnnoy (52)
RcppArmadillo (223)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (137)
RcppGSL (4)
RcppHNSW (37)
RcppML (6)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (16)
RcppProgress (1)
RcppRoll (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (3)
RcppTOML (28)
RcppZiggurat (6)
Rcsdp (1)
RCurl (163)
RCy3 (1)
Rd2roxygen (0)
RDAVIDWebService (0)
RDCOMClient (1)
rdd (1)
rdflib (1)
Rdimtools (1)
rdocx (1)
Rdpack (47)
Rdsdp (1)
reactable (3)
reactlog (1)
reactome.db (1)
ReactomeGSA (1)
ReactomeGSA.data (71)
ReactomePA (1)
reactR (12)
readbitmap (1)
reader (1)
readJDX (1)
readODS (1)
readr (105)
readstata13 (1)
readxl (88)
rearrr (1)
REBayes (1)
recipes (69)
reclin (1)
recommenderlab (7)
recosystem (12)
reda (1)
REddyProc (1)
redison (1)
redland (1)
redoc (1)
redux (1)
refinr (1)
RefManageR (1)
refund (1)
reghelper (1)
registry (2)
RegParallel (73)
regress (1)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (8)
relimp (1)
relsurv (1)
remaCor (5)
rematch (77)
rematch2 (1)
remotes (94)
renderthis (1)
rentrez (2)
renv (172)
report (1)
reporter (1)
reporting (1)
ReportingTools (0)
repr (2)
reprex (39)
repurrrsive (1)
reReg (1)
reshape (3)
reshape2 (9)
ResidualMatrix (1)
ResourceSelection (1)
restfulr (17)
restfulSEData (52)
RestRserve (7)
reticulate (58)
revealgenomics (2)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (35)
Rfast (16)
Rfast2 (1)
rfcdmin (3)
Rfit (1)
RFOC (7)
RforProteomics (131)
rgbif (1)
RGCCA (0)
rgdal (18)
rgenoud (1)
rgeos (26)
rgexf (1)
rgl (4)
Rglpk (2)
RGMQLlib (48)
rgnparser (1)
RgoogleMaps (7)
Rgraphviz (1)
rhandsontable (2)
rhdf5 (2)
rhdf5filters (1)
Rhdf5lib (3)
rheumaticConditionWOLLBOLD (25)
rhino (7)
RhpcBLASctl (9)
Rhtslib (2)
rhub (3)
rice (1)
RICGA.clinical (1)
RIdeogram (1)
ridigbio (1)
rintrojs (7)
rio (8)
RIPSeeker (1)
RIPSeekerData (11)
RISCA (1)
riskmetric (1)
riskRegression (2)
RITANdata (58)
ritis (1)
RItools (1)
riverplot (1)
rj (0)
rj.gd (0)
rjags (2)
rJava (39)
RJDBC (1)
rjson (16)
rjsoncons (1)
RJSONIO (26)
Rlab (1)
Rlabkey (1)
rlang (345)
rlaR (1)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
RLHub (23)
rliger (1)
rlist (1)
rlistings (1)
RLRsim (1)
rly (0)
Rmagic (1)
rmapshaper (1)
RMariaDB (7)
rmarkdown (270)
RMassBankData (51)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (2)
rmeta (1)
rminer (1)
rmio (1)
rMisbeta (1)
Rmisc (1)
Rmpfr (12)
Rmpi (1)
rms (3)
rmsb (1)
rmspc (1)
RMTstat (1)
rmutil (0)
rMVP (1)
RMySQL (4)
RNAi (1)
RNAinteractMAPK (30)
RNAmodR.Data (73)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (2)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (307)
RNASeqDataSubset (2)
RNASeqPower (0)
RNASeqRData (5)
RnaSeqSampleSizeData (102)
RnaSeqTutorial (9)
rnaturalearth (2)
rnaturalearthdata (1)
RnBeads (1)
RnBeads.hg19 (185)
RnBeads.hg38 (98)
RnBeads.mm10 (73)
rnbeads.mm10 (0)
RnBeads.mm9 (88)
RnBeads.rn5 (24)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (2)
rngWELL (1)
RNOmni (1)
robfilter (2)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (12)
robustbase (27)
robustlmm (1)
RobustRankAggreg (0)
ROC (1)
ROCR (2)
RODBC (3)
ROI (1)
ROI.plugin.glpk (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
roll (1)
rols (0)
Rook (1)
rootSolve (14)
ropls (1)
roptim (0)
ROracle (1)
ROSE (1)
rosettR (1)
rosm (1)
rotl (2)
round (1)
roxygen (1)
roxygen2 (98)
rpact (1)
rpart (85)
rpart.plot (2)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (7)
RPostgres (20)
RPostgreSQL (3)
RPresto (1)
rprintf (1)
rprojroot (164)
RProtoBuf (1)
RProtoBufLib (1)
rpsftm (1)
RPtests (1)
RPushbullet (1)
Rqc (1)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
RRBSdata (30)
rrcov (16)
rRDPData (39)
rredlist (1)
RRPP (1)
rrsq (1)
rsample (23)
Rsamtools (3)
rsatscan (1)
rsbml (0)
RSclient (1)
rsconnect (70)
RSEIS (7)
RSelenium (1)
Rserve (8)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
rsnps (1)
Rsolnp (2)
rsparkling (1)
RSpectra (16)
Rspectra (1)
rspm (1)
RSQLite (174)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (0)
rstan (11)
rstanarm (1)
rstanemax (1)
rstantools (11)
rstatix (21)
rstpm2 (1)
rstudioapi (157)
Rsubread (1)
rsvd (10)
rsvg (3)
Rsymphony (1)
rtables (2)
RTCGA.clinical (291)
RTCGA.CNV (62)
RTCGA.methylation (60)
RTCGA.miRNASeq (115)
RTCGA.mRNA (179)
RTCGA.mutations (87)
RTCGA.PANCAN12 (110)
RTCGA.rnaseq (135)
RTCGA.RPPA (55)
RTCGAToolbox (0)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
rtracklayer (1)
Rtsne (28)
Rttf2pt1 (3)
rtweet (7)
Ruchardet (1)
rugarch (2)
RUnit (6)
runjags (1)
runonce (0)
Runuran (1)
ruODK (1)
ruv (1)
RUVnormalizeData (64)
RUVseq (0)
RVAideMemoire (1)
Rvcg (1)
rvcheck (3)
RVenn (0)
rversions (45)
rvertnet (1)
rvest (60)
rvg (2)
Rvmmin (1)
RVtests (1)
Rwave (7)
RWiener (1)
rworldmap (1)
RxODE (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (70)
S4Arrays (2)
S4Vectors (11)
S4vectors (1)
saemix (1)
safeBinaryRegression (1)
safetyData (1)
safetyexploreR (1)
SAGx (1)
SAIGEgds (1)
sampleClassifierData (40)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (5)
sandwich (9)
santoku (1)
sas7bdat (1)
SASmixed (1)
sass (258)
SASxport (1)
satchel (1)
satellite (1)
SBGNview.data (175)
SC3 (0)
scaeData (0)
scagnostics (1)
ScaledMatrix (1)
scales (117)
scalreg (1)
scam (1)
scanMiRData (60)
scATAC.Explorer (20)
SCATE (0)
SCATEData (83)
scater (1)
scatterD3 (1)
scattermore (34)
scatterpie (19)
scatterplot3d (41)
scClassify (0)
scclusteval (1)
sccore (1)
sccs (1)
scCustomize (2)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (1)
scDC (0)
sceptre (1)
scGate (1)
schoolmath (1)
scHOT (0)
scico (1)
scidb (1)
Scillus (1)
scistreer (7)
scITD (1)
SCLCBam (33)
scLinear (1)
scMerge (1)
scMultiome (45)
scoringRules (1)
SCP (1)
scpdata (59)
scPipe (0)
scran (1)
scRepertoire (1)
scrime (5)
scRNAseq (1637)
scRNASeq.spatial (0)
scrypt (4)
scs (1)
scTHI.data (37)
SCtools (1)
sctransform (32)
sctrnasform (1)
scuttle (9)
scviewer (1)
sda (1)
SDMTools (1)
sdtmchecks (1)
secretbase (1)
secrets (1)
see (1)
segmented (16)
selectr (1)
semEff (1)
semTools (1)
sen2r (1)
sendmailR (2)
sensitivity (1)
sensobol (1)
seq2pathway (0)
seq2pathway.data (112)
SeqArray (1)
seqArray (1)
seqc (27)
seqCNA.annot (56)
seqinr (10)
seqLogo (1)
seqmagick (3)
seqminer (10)
sequenza (1)
SeqVarTools (0)
seriation (25)
serumStimulation (18)
servr (4)
sesame (1)
sesameData (811)
sessioninfo (30)
set6 (1)
setRNG (1)
sets (1)
settings (1)
Seurat (54)
seurat (1)
SeuratData (1)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (41)
SeuratWrapper (1)
SeuratWrappers (1)
seventyGeneData (25)
sf (62)
SFEData (86)
sfheaders (15)
sfsmisc (3)
sftime (1)
sgeostat (1)
SGP (1)
shadowtext (16)
shape (32)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (1)
SHELF (1)
shinipsum (1)
shiny (222)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shiny.semantic (1)
shinyAce (2)
shinyalert (1)
shinyauth (1)
shinyauthr (1)
shinyBS (10)
shinybusy (9)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (3)
shinydashboardPlus (8)
shinydisconnect (1)
shinyEffects (1)
shinyfeedback (0)
shinyFeedback (1)
shinyFiles (12)
shinyglide (1)
shinyhelper (5)
ShinyItemAnalysis (27)
shinyjqui (1)
shinyjs (6)
shinyloadtest (1)
shinyLP (2)
shinymanager (2)
shinyMatrix (1)
shinyMethyl (1)
shinyMethylData (54)
shinyMobile (1)
shinypanel (7)
shinyscreenshot (4)
shinySelect (0)
shinystan (1)
shinytest (2)
shinytest2 (3)
shinythemes (2)
shinytoastr (1)
shinyTree (3)
Shinyusagelogr (1)
shinyvalidate (53)
shinyWidgets (85)
ShortRead (1)
showimage (1)
showtext (2)
showtextdb (1)
SIAMCAT (1)
SID (1)
sigaR (0)
sigclust (1)
Sigfried (1)
siggenes (1)
Signac (11)
signac (1)
signal (1)
signatureSearchData (186)
sigPathway (0)
SimBenchData (22)
SimComp (1)
SimDesign (1)
simex (1)
SimInf (1)
simpar (1)
simpIntLists (89)
simpleaffy (0)
simplermarkdown (1)
simplifyEnrichment (1)
simputation (1)
simr (1)
simsurv (1)
Single.mTEC.Transcriptomes (22)
SingleCellExperiment (10)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellMultiModal (89)
singleCellTK (1)
SingleMoleculeFootprintingData (41)
SingleR (1)
singscore (1)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
sitmo (15)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (10)
SkewHyperbolic (2)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (0)
slam (3)
slickR (0)
slider (21)
slingshot (1)
sloop (1)
slopeR (1)
sm (1)
smacof (1)
SmartEDA (1)
smcfcs (1)
sme (1)
smfishHmrf (1)
smldesign (1)
smokingMouse (11)
smooth (1)
smoother (1)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (8)
sn (11)
sna (2)
SNAData (24)
SNAGEEdata (57)
snakecase (20)
SnapATAC (1)
snow (17)
SnowballC (3)
snowfall (1)
snpar (1)
SNPhoodData (38)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (0)
SNPRelate (1)
snpStats (1)
sodium (12)
softImpute (1)
soilDB (1)
solrium (1)
som (1)
SomaDataIO (1)
SomatiCAData (20)
SomaticCancerAlterations (80)
SomaVarDB (1)
SOMbrero (1)
sommer (1)
sortable (6)
sos (1)
SoupX (1)
sourcetools (60)
sp (100)
spacefillr (1)
spacetime (2)
spacrt (1)
spade (0)
spam (5)
spam64 (1)
spaMM (1)
sparkline (1)
sparklyr (11)
SPARQL (1)
SparseArray (1)
sparsebn (1)
SparseGrid (1)
SparseM (3)
sparseMatrixStats (1)
sparsepca (1)
sparsesvd (18)
spatial (44)
SpatialCPie (1)
SpatialDatasets (11)
spatialDmelxsim (15)
SpatialEpi (1)
SpatialExperiment (1)
spatialLIBD (246)
spatialreg (1)
spatstat (2)
spatstat.core (24)
spatstat.data (32)
spatstat.explore (24)
spatstat.geom (44)
spatstat.linnet (2)
spatstat.model (2)
spatstat.random (31)
spatstat.sparse (33)
spatstat.utils (33)
spatsurv (1)
spd (1)
spData (15)
spdep (9)
spec (1)
spectacles (1)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (2)
spgs (1)
SPIA (0)
SpidermiR (1)
SpikeIn (44)
SpikeInSubset (93)
splancs (7)
splatter (1)
spliceR (0)
SplicingVizUtils (1)
splines2 (1)
splitTools (1)
spls (1)
splus2R (2)
spocc (1)
SPOTlight (1)
spqnData (38)
spsComps (1)
sqldf (1)
SQUAREM (2)
ssanv (1)
ssh (1)
SSPA (0)
stabledist (1)
stabs (1)
StanHeaders (11)
stargazer (1)
stars (3)
starter (1)
startup (5)
StatCharrms (1)
statmod (16)
statnet (1)
statnet.common (2)
statsExpressions (2)
statTarget (1)
STdeconvolve (1)
stdmchecks (1)
stdReg (1)
stemHypoxia (66)
stevedore (1)
STexampleData (236)
sticky (1)
stinepack (1)
stjudem (47)
stopwords (1)
storr (1)
strex (2)
string (1)
stringdist (20)
stringfish (9)
stringi (210)
stringr (203)
striprtf (1)
strucchange (1)
structToolbox (1)
styler (66)
SubcellularSpatialData (1)
subplex (1)
subselect (1)
SummarizedExperiment (3)
summarytools (1)
sunburstR (1)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
SuppDists (1)
supraHex (0)
survcomp (1)
survex (1)
survey (2)
survival (154)
survivalROC (1)
survminer (2)
survMisc (2)
survMS (1)
survPen (1)
survPresmooth (1)
susieR (18)
sva (1)
svd (1)
svDialogs (1)
svglite (29)
svGUI (1)
SVM2CRMdata (25)
svMisc (1)
svUnit (1)
swagger (1)
swamp (1)
Swiffer (1)
swirl (1)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (2)
synapser (1)
synapterdata (49)
synbreed (1)
syntenet (1)
Synth (1)
sys (182)
sysfonts (1)
systemfit (1)
systemfonts (160)
systemPipeRdata (216)
syuzhet (1)

T

table1 (1)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (3)
TabulaMurisData (64)
TabulaMurisSenisData (75)
tabulizer (1)
tabulizerjars (1)
TailRank (3)
tanggle (1)
tarchetypes (7)
targets (8)
TargetScoreData (43)
TargetSearchData (49)
tartare (70)
taskscheduleR (1)
TauStar (1)
taxize (1)
taxonomizr (1)
TBX20BamSubset (85)
TCC (6)
TCGAbiolinks (1)
TCGAbiolinksGUI.data (3167)
TCGAbiolinksGul.data (1)
TCGAcrcmiRNA (17)
TCGAcrcmRNA (24)
TCGAMethylation450k (65)
tcgaWGBSData.hg19 (4)
TCGAWorkflowData (89)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TeachingDemos (1)
teal (1)
teal.builder.modules (1)
teal.code (1)
teal.data (1)
teal.logger (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.modules.sanofi (1)
teal.reporter (1)
teal.slice (1)
teal.widgets (1)
templater (1)
tensor (1)
tensorA (7)
tensorflow (18)
TENxBrainData (104)
TENxBUSData (46)
TENxPBMCData (658)
TENxVisiumData (80)
TENxXeniumData (2)
tergm (1)
tern (1)
tern.gee (1)
tern.mmrm (1)
terra (60)
tesseract (1)
testit (1)
testthat (255)
texreg (2)
text2vec (1)
textshaping (76)
tfautograph (1)
TFBSTools (1)
tfdatasets (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (8)
tfrmt (1)
tfruns (13)
tgp (1)
TH.data (40)
thematic (5)
themeSanofi (1)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
ThresholdROC (1)
tibbke (1)
tibble (155)
tictoc (11)
tidybayes (1)
tidycensus (25)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidydr (1)
tidygraph (27)
tidyHeatmap (1)
tidylog (1)
tidymodels (13)
tidyposterior (1)
tidypredict (1)
tidyr (139)
tidyrules (1)
tidyselect (84)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (1)
tidyterra (1)
tidytext (3)
tidytlg (1)
tidytree (47)
tidyTree (1)
tidyverse (19)
tidyvpc (1)
tidyxl (1)
tiff (3)
tigris (26)
tikzDevice (1)
timechange (76)
timecoursedata (135)
timeDate (30)
TimeProjection (1)
timereg (1)
TimerQuant (18)
timeSeries (7)
timetk (2)
tinesath1cdf (25)
tinesath1probe (20)
tinkr (1)
tinysnapshot (1)
tinytest (1)
tinytex (277)
tippy (1)
tis (1)
tissueTreg (43)
TitanCNA (0)
titanic (1)
tkrplot (1)
tkWidgets (1)
TLMoments (1)
tm (2)
tmap (1)
TMB (33)
TMExplorer (30)
tmle (1)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (2)
TNO (1)
TOAST (1)
toastui (1)
tofsimsData (16)
tokenizers (3)
tokupika (1)
tolerance (1)
toOrdinal (1)
topdownrdata (42)
topGO (1)
topicmodels (1)
torch (1)
tornado (1)
Tplyr (1)
tracee (1)
trackViewer (1)
tradeSeq (1)
TrajectoryUtils (1)
tram (1)
transformr (1)
TransOmicsData (1)
transport (1)
tree (1)
treeio (9)
treemap (2)
treemapify (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1)
triangle (1)
triebeard (4)
trimcluster (0)
tripack (1)
trtf (1)
truncdist (1)
truncnorm (5)
truncreg (1)
TSCAN (1)
tseries (5)
tsfeatures (3)
tsibble (1)
tsibbledata (1)
tsModel (1)
tsne (1)
tsoutliers (1)
TSP (26)
TSSi (0)
ttdo (0)
TTR (5)
ttservice (1)
tuberculosis (17)
tufte (1)
TumourMethData (17)
tune (12)
tuneRanger (1)
twang (1)
twangContinuous (1)
tweeDEseqCountData (187)
tweedie (1)
tweenr (16)
twilight (0)
twosamples (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (0)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (0)
tximeta (0)
tximport (1)
tximportDat (1)
tximportData (818)
txtq (1)
tzdb (91)

U

uatools (1)
UCell (1)
uchardet (1)
ucminf (2)
udunits2 (1)
ufs (1)
umap (11)
UniprotR (1)
unitizer (1)
units (74)
unmarked (1)
unrtf (1)
UpSetR (1)
urca (2)
urlchecker (1)
urltools (1)
usdm (1)
useful (1)
usethis (101)
usmap (1)
usmapdata (1)
utf8 (241)
utilsRmd (1)
utilsStuff (1)
uuid (138)
uwot (47)

V

V8 (26)
validate (1)
valr (1)
VAM (1)
vaplot (1)
variables (1)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
VariantToolsData (20)
VariantWarehouseBMS (1)
varImp (1)
vars (1)
vaultr (1)
VBsparsePCA (1)
vcd (3)
vcfR (1)
vcr (1)
vctrs (324)
vdbR (1)
vdiffr (2)
VectraPolarisData (22)
vegan (4)
vegawidget (1)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (8)
VennDiagram (1)
venneuler (1)
VGAM (13)
VGAMextra (1)
vhydeg (0)
VIM (1)
vimp (1)
VineCopula (1)
vioplot (1)
vip (1)
vipor (12)
viridis (158)
viridisLite (146)
viridislite (0)
visdat (1)
visNetwork (4)
visR (1)
vistime (30)
vitae (1)
vpc (1)
vroom (176)
vscDebugger (1)
vsn (1)
vulcandata (53)

W

waffle (1)
waiter (10)
wakefield (1)
waldo (187)
warp (11)
wateRmelon (0)
waveTilingData (8)
wdm (1)
wdman (1)
weaver (0)
webchem (1)
webdriver (1)
WeberDivechaLCdata (47)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (34)
webshot2 (2)
websocket (1)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (2)
WES.1KG.WUGSC (47)
wesanderson (1)
WGCNA (12)
WGScan (1)
WGSmapp (49)
wheatmap (1)
whereami (0)
whisker (65)
whitening (1)
whoami (1)
widgetTools (1)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (2)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (233)
wk (72)
wkb (1)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (11)
workflowsets (10)
WorldFlora (1)
worrms (1)
wrapr (1)
Wrench (1)
writexl (12)
WriteXLS (2)
wrMisc (1)
WRS2 (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xbioc (1)
xcms (1)
xcoredata (37)
xfun (323)
xgboost (52)
xgxr (1)
XhybCasneuf (20)
XIFF (1)
XLConnect (1)
XLConnectJars (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
XML (122)
xml2 (214)
xmlparsedata (1)
xopen (1)
xpose (1)
xpose.nlmixr2 (1)
xpose4 (1)
xrf (1)
xslt (1)
xtable (3)
xts (14)
XVector (2)

Y

yaImpute (1)
yaml (165)
yardstick (16)
yeastCC (97)
yeastExpData (125)
yeastGSData (17)
yeastNagalakshmi (77)
yeastRNASeq (74)
ymlthis (0)
yri1kgv (8)
yriMulti (5)
yspec (1)
yulab.utils (49)

Z

zCompositions (9)
zeallot (1)
zebrafishRNASeq (196)
zelusutils (1)
zen4R (1)
zenith (1)
zinbwave (1)
zip (154)
Ziploc (1)
zlibbioc (2)
zoo (43)